八国联军入京，朝廷出奔，举国局势一度混乱。黄飞鸿（赵文卓 饰）与父亲黄麒英（刘询 饰）、十四姨（王静莹 饰）、徒弟梁宽（莫少聪 饰）、鬼脚七（熊欣欣 饰）一行人南下番禹，欲与十三姨（关之琳 饰）、猪肉荣（郑则仕 饰）、牙擦苏（郭晋安 饰）汇合。师徒于路同担心海盗夺粮的南粤米仓发生误会，两帮人不打不相识，黄飞鸿助其将盗米贼扭送衙门，惊觉盗米竟是差役领班谢四（张铁林 饰）指使。原来南海海盗趁局势混乱，活动频繁，使番禹一地早无官员统制，差役不得已靠偷盗维持口粮。黄飞鸿有感谢四等人忠义，遂放弃赴港计划，与当地海盗单眼英、张玉麟、张保仔等人展开连场搏杀…… 本片是徐克执导黄飞鸿系列的第五部。
魏佳欢生日这天，父亲魏成功陪她登上环海游艇，然而一场突如其来的海难打破了一切，整艘游艇侧翻，众人纷纷落水。魏成功自哭喊声中醒来，发现自己身处一荒岛，目睹魏佳欢被一巨蛇叼走，于是随众人深入丛林，踏上营救之路。在这片与世隔绝的丛林里，无数怪异的史前生物暗藏其中，营救女儿的遥遥之途布满杀机。另一边，魏佳欢等人在蛇穴中醒来，在失去规则的封闭环境中，幸存者的人性也承受着巨大考验…
